Criamos uma ferramenta no Google Earth Engine para baixar os mapas da coleção 3 para um bioma, estado ou município selecionado.
https://code.earthengine.google.com/?accept_repo=users/mapbiomas/user-toolkit
Quando abrir o link busque na aba de scripts (janela esquerda da tela) o diretório [users/mapbiomas/user-toolkit] clique nele e coloque para rodar.
Se vc ainda não tem uma conta no Google Earth Engine acesse aqui e crie sua conta.
Depois é só rodar o script acima e gerar a tarefa de exportar o dados desejados para o seu Google Drive.
As vezes quando vc abre o Code Editor do Google Earth Engine o script não é acionado automaticamente, neste caso procure na aba scrips da caixa superior esquerda por:
Reader > users/mapbiomas/user-toolkit > mapbiomas-user-toolkit-download.js